Трунов ранее пытался оспорить отказ в регистрации в Верховном суде РФ, но потерпел неудачу.
Верховный суд 25 сентября 2009 года отклонил жалобу адвоката на решение Мосгорсуда, который подтвердил законность отказа избирательной комиссии зарегистрировать его кандидатом на выборы в Мосгордуму.
Суд принял в качестве оснований для отказа в регистрации Трунова три обстоятельства: неверное оформление заявления о согласии баллотироваться в депутаты Мосгордумы; ошибки, допущенные нотариусом при оформлении документов; неверное оформление подписных листов.
Трунов счел отклонение его жалобы нарушением Европейской конвенции о правах человека, а именно права на свободные выборы, обеспечивающее свободное волеизъявление народа при выборе органов законодательной власти, гарантированное статьей 3 Протокола № 1 к Конвенции, и права на справедливое и публичное разбирательство дела независимым и беспристрастным судом, гарантированное статьей 6.1 Конвенции.
Игорь Трунов, возглавляющий московское отделение партии "Правое дело", попытался выдвинуться кандидатом в депутаты Московской городской думы, несмотря на решение партии не участвовать в выборах. Поэтому он решил баллотироваться по одномандантному территориальному избирательному округу. Им должен был стать избирательный округ N14, по которому всегда проходит московский городской голова Владимир Платонов. Кроме Трунова, по одномандатным округам пытались выдвинуться также члены "Правого дела" Борис Надеждин, Сираждин Рамазанов и Елена Гусева.
В качестве адвоката Трунов, в частности, представлял интересы пострадавших при терактах в Москве в 2004 году, захвате террористами Театрального центра на Дубровке и делу майора Евсюкова.
В Страсбургском суде с Труновым уже знакомы. В частности, он обжалует там решения российских судебных властей по делу майора Евсюкова.