Основаниями для дальнейшего нахождения Пичугина в СИЗО стали тяжесть предъявленных ему обвинений, необходимость проведения большого объема следственных действий, а также доводы представителя следствия о том, что, находясь на свободе, обвиняемый может скрыться, уничтожить доказательства и повлиять на свидетелей.
Адвокат Пичугина Татьяна Акимцева обратилась в Мосгорсуд с кассационной жалобой, в которой просила отменить решение Басманного суда, а ее подзащитного освободить из-под стражи. "Содержание человека под стражей только в связи с тяжестью предъявленного ему обвинения является незаконным, так как противоречит постановлению Конституционного суда", - сказала она РИА "Новости".
Акимцева утверждала, что за пять месяцев следствия было произведено лишь три опознания и две очные ставки, и защите отказывали в ознакомлении с результатами экспертиз. "Так что говорить о большом объеме следственных действий не приходится", - отметила она
Начальник четвертого отдела Службы экономической безопасности компании ЮКОС Алексей Пичугин был задержан 19 июля 2003 года. Генпрокуратура РФ обвиняет его в организации покушения на убийство бывшего начальника управления Общественных связей мэрии Москвы, экс-советника бывшего главы ЮКОСа Михаила Ходорковского Ольги Костиной в ноябре 1998 года, в организации убийства двух жителей Тамбова - Ольги и Сергея Гориных - в 2002 году, а также в покушении на убийство бывшего сотрудника компании МЕНАТЕП Сергея Колесова в 1998 году.
В настоящее время Алексей Пичугин находится под стражей в следственном изоляторе "Лефортово". Он не признает своей вины.