Никита Николаевич Заболоцкий родился в 1932 году в Ленинграде, окончил Тимирязевскую сельскохозяйственную академию (1955) и аспирантуру при ней, кандидат биологических наук (1959). Работал научным сотрудником в московских НИИ и более 20 лет преподавал биохимию в Центральном институте усовершенствования врачей.
С середины 1970-х годов Никита Заболоцкий печатал воспоминания об отце в журнале "Вопросы литературы", в 1994 году выпустил биографическую книгу "Жизнь Н. А. Заболоцкого". Кроме того, составил сборник стихов, переводов, статей и писем Николая Заболоцкого и воспоминаний о нем "Огонь, мерцающий в сосуде" (Москва, 1995).
Лауреат премии им. Николая Заболоцкого города Уржума (1998), премии им. Николая Заболоцкого "Не позволяй душе лениться" (2000).