Джонс был отправлен в тюрьму в пятницу вечером после заседания суда, постановившего, что планируемая антиисламская акция может привести к всплеску насилия, и запретившего пастору в течение трех лет приближаться к самой большой в Америке мечети - исламскому центру в Диборне (штат Мичиган). Суд также потребовал от Джонса выплатить символический штраф - один доллар - в соответствии с принятым в 1846 году законом о необходимости выплаты штрафа теми, кто может представлять своими действиями "угрозу спокойствия".
Строптивый священнослужитель отказался платить, обвинив суд в нарушении его права на свободу слова, после чего был препровожден в местное пенитенциарное учреждение. Примерно через час Джонса и его идейного сторонника Уэйна Сэппа выпустили - после того, как неизвестный доброжелатель заплатил за них штраф.
В выпуски новостей пастор успел попасть еще накануне, и, как ни странно, вовсе не из-за выпадов против мусульман. После съемок в телепередаче с участием мусульманских лидеров на телеканале Fox 2 Джонс на парковке случайно выстрелил из своего пистолета. Пуля пробила днище автомобиля, никто не пострадал.
Имя Джонса прогремело на весь мир 20 марта, когда он в присутствии примерно 50 человек сжег копию Корана в одной из церквей во Флориде. Этим он спровоцировал беспорядки в Афганистане, во время которых погибли более ста человек. Первого апреля разъяренная толпа напала на офис ООН в Мазари-Шарифе. Среди погибших - десять сотрудников международной организации.
После инцидента президент Афганистана Хамид Карзай призвал конгресс США осудить сожжение Корана пастором и предотвратить подобные акции в будущем. Джонс никакой вины за собой не видит.
В 2010 году пастор уже собирался сжечь священную для мусульман книгу в десятую годовщину терактов 11 сентября в США и призывал своих прихожан сделать то же самое. Его слова вызвали бурную реакцию осуждения во всем мире, особенно в странах, где исповедуют ислам.