Изетбегович также был известен тем, что, как считается, в начале Второй мировой войны он, по приказу фашистов, рекрутировал в Боснии и Герцеговине молодежь в мусульманскую "Ханджар-дивизию" СС, которая была разбита под Сталинградом.
В течение последних лет Изетбегович страдал от серьезного ухудшения работы сердца. В прошлом году ему был имплантирован стимулятор сердечной деятельности, он также прошел недавно курс специального лечения в Саудовской Аравии.