По сообщению пресс-службы женевского отделения ООН, 7 апреля этого года Комитет получил информацию о том, что Толипхужаев был тайно казнен 1 марта 2005 года, несмотря на то, что ООН просила Ташкент не исполнять смертную казнь до рассмотрения этого дела Комитетом.
Председатель Комитета, француженка Кристин Шане направила 13 апреля письмо в министерство иностранных дел Узбекистана, в котором выражается "крайняя обеспокоенность" сообщением о тайной казни Толипхужаева в нарушение требований Комитета. Комитет также потребовал от правительства Узбекистана "немедленных разъяснений".
Толипхужаев был приговорен к смертной казни Военным судом Узбекистана 19 февраля 2004 года. В мае 2004 года дело Толипхужаева было зарегистрировано в Комитете ООН по правам человека, который обратился к властям Узбекистана с просьбой не исполнять приговор до принятия решения Комитетом.