По какому обвинению она арестована, пока неизвестно. Колесникова перестала выходить на связь 7 сентября. Очевидица рассказала Tut.by, что ее посадили в микроавтобус с надписью "Связь" и увезли в неизвестном направлении. Вслед за ней исчезли пресс-секретарь Координационного совета Антон Родненков и исполнительный секретарь Иван Кравцов.
Утром 8 сентября белорусские госСМИ и провластные Telegram-каналы сообщили, что Родненков и Кравцов уехали из Белоруссии на Украину, причем при прохождении одного из КПП на границе якобы пытались устроить "прорыв" и сбили пограничника, а Колесникову выпихнули из автомобиля, после чего она была задержана. Погранкомитет Белоруссии сначала сообщал, что на Украину выехали все трое оппозиционеров, но потом повторил версию СМИ и телеграм-каналов.
Вечером 8 сентября Кравцов и Родненков в ходе пресс-конференции в Киеве подробно рассказали о своем задержании и операции по их выдворению из Белоруссии. Обоих перевозили из одного ведомства в другое, Кравцову угрожали возбуждением уголовного дела о злоупотреблении служебными полномочиями, если он откажется "принимать тот вариант, в котором заинтересованы сотрудники" спецслужб.
По словам оппозиционеров, силовики придумали операцию по принудительному выдворению Колесниковой ради "деэскалации" ситуации в стране. На белорусском пункте пропуска в автомобиле Кравцова вместо Колесниковой и Родненкова находились сотрудники спецслужб, предъявившие их документы пограничнику. Колесникову и Родненкова планировалось подсадить на нейтральной полосе, но Мария оказала сопротивление, порвала свой паспорт и смогла выбраться из машины, куда ее насильно посадили, через заднее окно.
После этого Кравцова и Родненкова попытались задержать повторно, заблокировав дорогу, но Кравцов смог объехать заслон по обочине и благополучно добраться до украинского пункта пропуска, несмотря на погоню.
По словам Родненкова, спецслужбы заготовили для них целый набор документов для пересечения границы: тест на коронавирус (который сами оппозиционеры не сдавали), медицинскую страховку, разрешение на временное проживание на Украине, билеты для Кравцова и Родненкова в Турцию, а для Колесниковой - в Вену и оттуда - в Мюнхен.
Президент Белоруссии Александр Лукашенко в большом интервью российским журналистам заявил о ссылкой на "доложенную" ему информацию, что оппозиционеры "сбежали на Украину". По его словам, они пересекли белорусский КПП по "заранее заготовленным" документам, а на участке границы, где было выставлено усиление, "естественно, их остановили". "Они на своем автомобиле - по газам. Ее [Колесникову] то ли выбросили из машины на ходу, сами, кто же ее еще мог выбросить..." По версии Лукашенко, нарушение границы состояло в том, что оппозиционеры якобы пошли "напролом" через усиление.
9 сентября в квартире Марии Колесниковой прошел обыск. В день исчезновения Марии член президиума Координационного совета Максим Знак рассказывал, что тем утром Колесникова шла на почту забрать уведомление из РУВД Центрального района Минска о протоколе за участие в несанкционированной массовой акции 30 августа и письмо из КГБ. Ранее Колесникова проходила в качестве свидетеля по делу о деятельности КС.