Карпенко в качестве спортсмена выиграл чемпионат СНГ в 1991 году, а в 1992-м стал чемпионом России и вооруженных сил. В 1993 году он стал финалистом чемпионата Европы по кикбоксингу.
Позднее выступал за немецкий клуб по кикбоксингу в Берлине, стал чемпионом столицы Германии и победителем многих международных турниров среди профессионалов. В последние годы Карпенко тренировал молодых спортсменов.
Сын Сергея Карпенко Юрий заявил о пропаже своего отца неделю назад. Юрий известен как блогер под псевдонимом Юра Зефир, отмечает sport24.