Второе место на старте воскресной гонки займет напарник Шумахера по Ferrari Рубенс Барикелло. Вторую стартовую линию оккупировали пилоты McLaren Дэвид Култхард и Кими Райкконен, а третью √ болиды Williams Ральфа Шумахера и Хуана-Пабло Монтойи.
Нынешняя квалификация была прервана более чем на час из-за тяжелой аварии пилота Toyota Алана Макниша. Шотландец потерял управление машиной в 130-градусном повороте, Toyota ударилась в защитный барьер и развалилась. Алану повезло, удар был очень сильным и никаких серьезных повреждений гонщик не получил. Он смог самостоятельно покинуть машину. Окончательные выводы будут сделаны после медицинского обследования, но он наверняка сможет участвовать в гонке.
Результаты квалификации перед Гран-при Японии:
| 1. Михаэль Шумахер | Ferrari | 1:31,317 |
| 2. Рубенс Баррикелло | Ferrari | 1:31,749 |
| 3. Дэвид Култхард | McLaren | 1:32,088 |
| 4. Кими Райкконен | McLaren | 1:32,197 |
| 5. Ральф Шумахер | Williams | 1:32,444 |
| 6. Хуан Пабло Монтойя | Williams | 1:32,507 |
| 7. Такума Сато | Jordan | 1:33, 090 |
| 8. Джанкарло Физикелла | Jordan | 1:33,276 |
| 9. Жак Вильнев | BAR | 1:33,349 |
| 10. Дженсон Баттон | Renault | 1:33,429 |
| 11. Ярно Трулли | Renault | 1:33,527 |
| 12. Ник Хайдфельд | Sauber | 1:33,533 |
| 13. Мика Сало | Toyota | 1:33,742 |
| 14. Эдди Ирвайн | Jaguar | 1:33,915 |
| 15. Фелипе Масса | Sauber | 1:33,929 |
| 16. Оливье Панис | BAR | 1:34,192 |
| 17. Педро де ла Роса | Jaguar | 1:34,227 |
| 18. Аллан Макниш | Toyota | 1:35,191 |
| 19. Марк Уэббер | Minardi | 1:35,958 |
| 20. Алекс Юнг | Minardi | 1:36,267 |