Решение о дисквалификации Каньяса было принято после того, как анализы показали наличие в организме теннисиста запрещенного препарата гидрохлоротиазида (HCT). Это мочегонное средство, включенное в список запрещенных веществ, было обнаружено в организме Каньяса в феврале 2005 года, когда он выступал на турнире в Акапулько (Мексика). С медицинской точки зрения, мочегонные средства применяются для лечения пациентов от почечной дисфункции. Согласно Всемирному антидопинговому кодексу, который вступил в силу с 1 января 2005 года, мочегонные средства являются запрещенным препаратом во всех видах спорта.
Независимые эксперты Теннисной антидопинговой программы провели 21 и 22 июля заседание в Нью-Йорке по делу Каньяса, и трибунал единодушно постановил, что аргентинец виновен в употреблении допинга.
Согласно наложенным на Каньяса санкциям, он должен вернуть премиальные в размере $276 070. Кроме этого, с него будут сняты 525 рейтинговых очков в одиночном разряде и 95 очков в парном. Каньяс может вернуться на профессиональный корт 11 июня 2007 года - на тот момент аргентинцу будет 29 лет.
Каньяс стал четвертым аргентинцем, у которого был обнаружен допинг, после Хуана Игнасио Челы, Гильермо Кории и Мариано Пуэрты.