Причиной столь жесткого наказания стало вмешательство правительства Греции в дела HFF, что нарушает правила ФИФА о самостоятельности и независимости национальных федераций от правительства страны.
В сентябре 2005 года HFF была уведомлена о том, что до 15 июля 2006 года федерации необходимо было добиться от парламента Греции поправок к национальному закону о спорте, чтобы он соответствовал требованиям международного и европейского футбола.
Чиновники HFF обвиняют в сложившейся ситуации министра спорта Греции Гиоргиса Орфаноса, который не внял предостережениям со стороны ФИФА.
Греция является чемпионом Европы 2004 года, но отборочный цикл к ЧМ-2006 команда Отто Рехагеля провела неудачно, не сумев квалифицироваться для поездки в Германию.