В прошлом сезоне Погребняк провел за "Томь" 16 матчей в первенстве ФНЛ, забив 3 мяча. Также футболист отметился голом в одной игре за Кубок России.
Кирилл Погребняк является младшим братом экс-нападающего сборной России Павла Погребняка, выступающего за английский "Рединг". Также у него есть брат-близнец Николай, который тоже принадлежит "Томи", но играет в аренде за "Иртыш" на позиции защитника.