Так, следствие обвиняет Николая Аксененко в незаконном повышении зарплаты и выплате высоких премий высокопоставленным чиновникам его ведомства. Например, двоим из своих заместителей министр распорядился выдать 60 тыс. и 100 тыс. руб. премиальных.
Кроме того, следствие обвинило Аксененко в незаконном создании шести внебюджетных фондов, в частности, "фонда поддержки учебных заведений при министерстве", "фонда здравоохранения", "финансового резервного фонда, а также "фонда инвестиции программ МПС".
По мнению защиты, "все упомянутые действия Аксененко входят в круг его полномочий" и, кроме того, были совершены с одобрения коллегии МПС.
Генпрокуратура РФ предъявила министру обвинение в превышении должностных полномочий, повлекшем ущерб государству на сумму более 70 млн. руб.
Прокуратура также проверяет материалы о нарушениях, выявленных в МПС Счетной палатой РФ. Речь идет о незаконном расходовании государственных средств в 1997 году на общую сумму 700 млрд. руб., предназначавшихся для реализации правительственной программы по северному завозу.