Ранее ликвидировать ресурс требовала прокуратура Северной Осетии. По версии следователей, тот "занимается разжиганием межнациональной розни". Представители сайта назвали данные требования абсурдным, поскольку "Ингушетия.Ru" не является электронным СМИ. Кроме того, сайт физически расположен не в России, поэтому обеспечить исполнение решения суда, будь оно вынесено, оказалось бы практически невозможно.
В июле 2007 года против сайта возбудила дело Кунцевская межрайонная прокуратура Москвы. Ресурс обвиняли в нарушении части 1 статьи 282 УК РФ (возбуждение ненависти либо вражды, а равно унижение человеческого достоинства). Наказание по данной статье может составить лишение свободы на срок до двух лет.
В самой Ингушетии продолжает действовать запрет на доступ к сайту, введенный по указанию министра внутренних дел республики Мусы Медова с ноября прошлого года. Недавно был заблокирован доступ к блогу сайта в "Живом журнале".
"Ингушетия.Ru" выступает против главы республики Мурата Зязикова. По словам Магомеда Евлоева, который владеет ресурсом, местные власти стремятся "изолировать" представителей оппозиции, чтобы подавить "протестные настроения" населения, недовольного политикой Зязикова. В конце января Евлоев был объявлен в розыск.