Уроженец Ставрополя, он в числе 7 милиционеров погиб в схватке с уничтоженной в ауле Тукуй-Мектеб Нефтекумского района бандой боевиков-террористов. На городском кладбище гроб с телом Евгения Харченко был предан земле под залпы вечной памяти из табельного милицейского оружия.
Вместе с Евгением Харченко при уничтожении банды в Тукуй-Мектебе погибли капитан ОВД Курского района края Дмитрий Дерманский, два его сослуживца по курскому ОВД - оперуполномоченные старший лейтенант Артем Юдин и лейтенант Иван Воронин, 3 сотрудника ОМОН краевого ГУВД - сержант Владимир Бубнов, прапорщики Андрей Силин и Владимир Горобов.
Их тела, как сообщили ИТАР-ТАСС в отделе информации краевого ГУВД, отправлены для захоронения в те города и районы Ставрополья, где они родились, где проживают их родные и близкие.