В апреля апреле президент Владимир Путин подписал указ о ликвидации ФМС и Федеральной службы по контролю за незаконным оборотом наркотиков (ФСКН) как самостоятельных федеральных ведомств, передав их в ведение МВД России, а на базе внутренних войск и спецподразделений МВД создал новую силовую структуру - Национальную гвардию (Росгвардия).
Согласно указу президента, ФМС должна прекратить свое существование до 31 декабря 2016 года. Ее полномочия передаются в МВД. Более 80% сотрудников этой службы в настоящее время выведены за штат. Предполагается, что при переходе в МВД их число будет сокращено с 37 тысяч до 26 тысяч человек.
Пресса отмечала, что бывшие главы ФСКН и ФМС Виктор Иванов и Константин Ромодановский остались не у дел, в то же время предполагая, что без работы они в итоге не останутся.
Между тем в конце июля СМИ сообщили о прокурорской проверке в отношении руководства упраздненной ФМС в связи с выделением сотрудникам ведомства многомиллионных субсидий на приобретение жилья. Согласно этим данным, секретарша Ромодановского получила 22 млн рублей на покупку квартиры в Москве. Бывший заместитель Ромодановского пояснил, что руководству ничего не оставалось, кроме как выдавать субсидии - иначе сотрудники ФМС начинали заниматься поборами.
Поводом для прокурорской проверки стал отчет Счетной палаты РФ, которая выявила неэффективность использования бюджетных средств в ФМС в 2015 году. Нарушения выявлены на общую сумму 6,4 млрд рублей.