По их словам, следователи основали свои доказательства даже на невысказанных мыслях свидетелей. Например, на одном из допросов матери Игоря Светланы Сутягиной ей дали послушать пленку телефонных разговоров их семьи √ судя по всему, телефон прослушивался не один месяц. Указав на паузу в разговоре, агент ФСБ сказал: "Вот видите, вы сделали паузу, я знаю, о чем вы подумали, вы беспокоились, вы знали, что ваш сын делает что-то плохое". Речь шла о разговоре, никак не относящимся даже к работе Игоря.
Как говорят родители, жена и адвокаты Игоря Сутягина, никаких секретных данных у него никогда не было, а все обвинение строится на том, что он, основываясь на доступных фактах, взятых, в основном, из газеты "Красная звезда", пытался провести анализ текущего состояния дел в российской армии. По словам жены Сутягина, вся его комната была завалены газетными вырезками.
Известно, что агенты ФСБ также обыскали московскую квартиру студента Принстонского университета Джошуа Хэндлера, который встречался с Сутягиным и которого шеф ФСБ Николай Патрушев назвал шпионом - уже после его отъезда из России. Хэндлер, бывший активист Greenpeace, называет обвинения абсурдными.
По мнению западных наблюдателей, на лицо все признаки возврата к методам КГБ. Российские власти ищут подрывную деятельность в самых неожиданных местах. Например, московскому отделению Армии спасения было отказано в регистрации. Армию спасения назвали милитаризованной боевой группой. А на церемонии в Кремле 20 декабря в честь работников ФСБ Владимир Путин призвал своих бывших коллег вспомнить свое кэгэбэшное прошлое и "сохранять ценные аспекты, которые всегда присутствовали в работе органов безопасности".
В обвинении, выдвинутом Сутягину, говорится, что он занимался шпионской деятельностью в пользу США, когда участвовал в научной конференции в Великобритании в начале 1998 года. ФСБ не нравились связи Сутягина с иностранцами. Как говорит отец Игоря Вячеслав Сутягин, однажды следователь задал ему вопрос: "Как вы думаете, встречался ли Ваш сын с иностранцами, когда был в Англии?".