Ступа была возведена в 2008 году на территории московской усадьбы Лопухиных, где располагается музей имени Рериха Международного центра Рерихов. В декабре 2015 года Росимущество передало усадьбу в распоряжение Государственного музея искусства народов Востока. В июне ряд СМИ сообщил о том, что ступу планируют снести.
"Многонациональный народ Российской Федерации имеет богатейшие духовные традиции. Культурные и религиозные традиции буддизма являются их неотъемлемой частью и важной составляющей мировой культуры. Мы считаем, что никакими причинами нельзя оправдать разрушение Ступы трех драгоценностей в общественном Музее имени Н. К. Рериха в Москве, ибо ступа является достоянием многонационального народа России. Восемь лет она существует в столице нашей страны и приносит благо всем живым существам", - говорится в обращении, подписанном верховным ламой Тувы Лопсаном Чамзы и верховным ламой Калмыкии Тэло Тулку Ринпоче.
Ламы заявили, что за время своего существования ступа "стала центром буддизма в столице России, а общественный музей Рериха - местом проведения ежегодных фестивалей и дней буддийской культуры". По их словам, она "по праву считается уникальной буддийской святыней".
Ступа является традиционным архитектурным сооружением в буддизме. Она заполняется буддийскими реликвиями. Ступы могут возводиться в честь какого-либо события. В частности, открытие Ступы трех драгоценностей было приурочено к 80-летию завершения центрально-азиатской экспедиции Рерихов.
Семейство Рерихов - знаменитая династия русских художников, мыслителей и ученых. Ее основатель Николай Рерих создал около семи тысяч картин, многие из которых находятся в известных галереях мира, и написал около 30 литературных трудов.