Хотя достигнута принципиальная договоренность о том, что торжественная церемония подписания Акта о каноническом общении состоится в мае 2007 года, еще не решен ряд проблем. Среди них - судьба приходов Зарубежной церкви, созданных на территории России. К тому же, последний Архиерейский Синод РПЦЗ, состоявшийся в середине декабря, поставил новые вопросы.
В частности, речь идет о разрешении приходам РПЦЗ в течение переходного периода самостоятельно решать вопрос, упоминать или нет на богослужениях имя Патриарха Московского и всея Руси. В интервью ИТАР-ТАСС член комиссии Московского Патриархата по диалогу с РПЦЗ протоиерей Николай Балашов сказал, что для него стало новостью "внесение дополнения в согласованный и опубликованный совместный документ". "Поминовение предстоятеля Русской православной церкви всеми ее клириками и епископами - существенный признак церковного единства", - подчеркнул Балашов. Он заметил, что в последнем решении зарубежного Синода "также говорится, что прекращение поминовения предстоятелей - явное нарушение канонических норм". Балашов пояснил, что "мысль о переходном периоде, в течение которого будет происходить окончательное урегулирование некоторых канонических вопросов, высказывалась и ранее, но совсем в другом контексте - в отношении приходов РПЦЗ, действующих на канонической территории РПЦ". Тем не менее, представитель Московского Патриархата выразил надежду на то, что по этому вопросу будет выработана общая позиция с Зарубежной церковью