Иерарх призвал Московскую Патриархию "прекратить незаконные действия в Абхазии, связанные с поддержкой лиц, не подчиняющихся Закону Божию и по собственной воле меняющих церковные правила". Свои претензии митрополит Даниил в письменном виде передал председателю Отдела внешних церковных связей Московского Патриархата митрополиту Смоленскому и Калининградскому Кириллу (Гундяеву).
Митрополит Даниил, в частности, протестует против награждения орденом Русской Православной Церкви отлученного от Грузинской Православной Церкви священника Виссариона Пилия. Этот человек, поясняет митрополит Даниил, провозгласил себя главой Абхазской епархии и получил поддержку РПЦ без учета мнения Грузинской Церкви.