Как свидетельствуют данные Управления Минюста РФ по Башкирии, всего в республике на сегодняшний день зарегистрировано 622 религиозных организации. Из них около 70 были впервые получили регистрационные документы Минюста только в 2002 году. В целом по республике насчитывается более 900 объединений.
По словам заместителя начальника Управления Минюста по Башкирии Раезы Раяновой, не все религиозные организации законопослушны. Некоторые из них проповедовали экстремистские идеи. За эти нарушения решениями судов Башкирии с начала текущего года ликвидировано 110 организаций, 54 исковых заявления находятся в стадии рассмотрения. Как правило, перерегистрацию не проходят нетрадиционные религиозные течения.