В ответ на это автор документа Виктор Алкснис обратил внимание депутатов на то, что в проекте речь идет не о запрете деятельности Римско-Католической Церкви в России, а о запрете деятельности ее административных организаций. "Ни в коем случае не идет речь о закрытии костелов и запрете прихожанам посещать их", - подчеркнул Алкснис. Он также пояснил, что необходимость обращения к президенту вызвана тем, что, в частности, "католическая церковь до сих пор считает, что Сахалинские острова принадлежат Японии". Необходимо также запретить регистрацию партий и организаций, подведомственных Римско-Католической Церкви на территории России, считает Алкснис.
Между тем в интервью радиостанции "Эхо Москвы" глава российских католиков митрополит Тадеуш Кондрусевич, комментируя утверждение депутата по поводу острова Сахалин, заявил, что "префектура Карафута" √ японское наименование Южного Сахалина - ранее действительно фигурировало в титуле одного из епископов Римско-Католической Церкви. Однако сейчас оно официально заменено на "префектуру Южного Сахалина", о чем свидетельствует документ из Ватикана.