Алексея привела в Православную церковь его жена Дарья. Он крестился в 1991 году и приобщил к религии брата. Дмитрий крестился в 1992-м.
"По воскресеньям в Московском храме Живоначальной Троицы в Серебряниках можно встретить двухметрового мужчину с аккуратно постриженной бородой. Он прислуживает батюшке и очень эффектно смотрится в черном подряснике. Мужчину этого зовут Алексей Ананьев. На службу обязательно приходит и его брат Дмитрий - они очень похожи, хотя Алексей старше на 5 лет. Поверить в то, что эти набожные бородачи с тихими голосами - настоящие миллиардеры, трудно. Но это так", - писал в 2006 году журнал Forbes.
"Общие нравственные ценности позволяют нам братские отношения ставить выше бизнеса, - говорил тогда Алексей, комментируя ситуацию, что весь их бизнес делится ровно поровну и в такой ситуации любое разногласие может завести дело в тупик. - Мы можем спорить с Дмитрием по какому-то вопросу, иной раз достаточно долго и жестко, но как только чувствую, что начинается переход на личности, этот вопрос теряет для меня интерес. Я лучше пересмотрю, скорректирую свою точку зрения, чем поссорюсь с братом". Такого мнения придерживается и Дмитрий.
Бизнес-структуры Ананьевых активно помогают Православной церкви. Братья помогают Псково-Печерскому монастырю, входят в попечительский совет по поддержке Центральной клинической больницы святителя Алексия, митрополита Московского. Ананьевы также участвовали в восстановлении Валаамского монастыря, Троице-Сергиевой лавры.