Проект Минэкономразвития очень напоминает план, подготовленный в прошлом году специалистами РАО и раскритикованный миноритарными акционерами. Таким образом, команда Германа Греф решила отвергнуть альтернативные рекомендации, подготовленные комиссией Госсовета РФ, созданной по указу президента Путина. Комиссия была создана президентом в декабре 2000 года после публичных дебатов о судьбе реформы между главой РАО ЕЭС Анатолием Чубайсом и советником президента Андреем Илларионовым.
Комиссия попыталась найти компромиссный вариант и договорилась с главой Минэкономразвития о внесении изменений в план, разрабатываемый специалистами ведомства. Однако устные обещания Германа Грефа остались лишь обещаниями, и министерство внесло проект реформы на рассмотрение правительства.
Как заявил газете советник президента РФ Андрей Илларионов, предлагаемые в программе меры являются "ударом по базовым принципам нормальной рыночной экономики", а также ударом по правам собственности и правам акционеров. Аналитик компании Prosperity Capital Management Александр Бранис также заявил, что, "если план реструктуризации РАО, подготовленный в Минэкономразвития, будет принят к исполнению, последствия для инвестиционного климата в России могут оказаться самыми ужасными".