Предприимчивый Богомолов еще в 1994 году при управлении ветеринарии мэрии создал отдел по профилактике и лечению болезней пчел, который поручил возглавить собственному племяннику. Однако чем занимался этот отдел, следователи так и не смогли выяснить. Получить отчет о работе отдела и ответ на вопрос, чем же все-таки занимались сотрудники этого отдела, поразительно напоминающего легендарную контору "Рога и копыта", милиционеры также не смогли.
Уголовное дело в отношении Александра Богомолова было возбуждено летом 2001 года после того, как ответственные лица в мэрии провели проверку контрольно-ревизионного управления Минфина РФ по Сибирскому федеральному округу. После возбуждения дела Богомолов был отстранен от должности начальника управления ветеринарии, которое он возглавлял с 1992 года. На время следствия и до суда он находится под подпиской о невыезде.