Вместе со своим другом Фрэнком Заппой, который придумал ему псевдоним, Ван Влиет еще в 60-е годы стал одним из самых влиятельных музыкальных новаторов, возглавив группу The Magic Band.
Лидер The Magic Band играл на многих инструментах; его музыка сочетала черты рок-н-ролла, блюза, фри-джаза, авангарда. Бифхарта называли одним из самых смелых музыкальных экспериментаторов и новаторов, считается, что его творчество повлияло на развитие нью-вейва, панка, пост-панка и альтернативного рока.
Альбом Ван Влиета "Trout Mask Replica" (1969) занял 58-е место в списке 500 величайших альбомов всех времен по версии Rolling Stone, в журнальной рецензии диск был назван "абсолютным триумфом".
Помимо работы со своей группой Magic Band, Ван Влиет был довольно известным художником, в последние годы его творчество было представлено в нью-йоркской Michel Werner Gallery, которая и объявила первой о смерти артиста.
В 1993 году известный фотограф и режиссер Антон Корбайн снял короткометражный биографический фильм "Don Van Vliet: Some YoYo Stuff".
С начала 1990-х Бифхарт был прикован к инвалидному креслу и жил с женой в Калифорнии, не появляясь на публике.